Кафедра или факультет все очень условно. Кафедра организационно должна принадлежать факультету. Военная кафедра скорее жаргонизм. В Бауманке в 90х вывеска"Военная кафедра" висела постоянно. А официальное название - "Факультет военного обучения" . В него входило несколько кафедр, и выпускали по нескольким специальностям, в зависимости от будущей гражданской специальности.
У нас в Камчат ГТУ был Факультет военного обучения, в него входило три кафедры. Но все называли военная кафедра и термин ФВО никогда не использовался. У нас в основном готовили по военно-морским специальностям, но также готовили мотострелков. Офицеры в основном были в форме ВМФ, но были и в общевойсковой.